疫情那几年,新闻里经常出现新冠病毒的电镜照片:一个个圆球,表面布满小突起,看起来像皇冠,所以叫冠状病毒。很多人好奇,这么小的东西,普通显微镜都看不见,照片是怎么拍出来的?答案在电子显微镜。
光学显微镜的分辨率受光波长限制,最多看到几百纳米,病毒直径通常只有几十到一百多纳米,正好卡在看不见的区间。电子显微镜用电子束代替光,电子的德布罗意波长极短,分辨率能到纳米甚至埃级,病毒的结构就清楚了。
拍病毒常用两种制样方法。一种是负染,把样品滴在铜网上,用磷钨酸或者醋酸铀染色,背景被染深,病毒颗粒凸出来显得亮,操作快、成本低,适合看整体形态。另一种是冷冻电镜,把样品快速冻成玻璃态薄冰,保住原生结构,再用低剂量电子成像,做三维重建,能看清蛋白的细节。
新闻里那种带颜色的病毒图,其实是后期上色的。电镜原始图像是灰度的,编辑为了区分包膜、刺突和内部核糖核蛋白,用软件叠了伪彩。所以看到红色球体配黄色突起,别以为是病毒本来长这样,那只是示意。
新冠病毒的典型结构:直径大约100纳米,最外层是脂质包膜,包膜上插着刺突蛋白S,像皇冠的尖;里面是核衣壳蛋白N包裹的RNA。刺突蛋白负责识别和入侵细胞,也是疫苗和抗体药物的主要靶点。冷冻电镜解析出S蛋白的三维结构之后,mRNA疫苗的设计才有了明确依据。
制样和成像的难点在于病毒太脆弱。负染的化学处理会让颗粒变形,冷冻电镜虽然保真,但要求样品浓度合适、冰层厚度均匀,太厚电子穿不透,太薄又容易损伤。拍一张高质量图往往要试很多次,数据处理量也大,三维重建要靠高性能计算集群跑。
所以一张看似简单的电镜图,背后是制样、成像、重建一整套流程。它不只是好看的科学图片,而是结构生物学的基础数据,决定了我们怎么理解病毒、怎么设计药物。下次再看到这类图,至少能分清哪些是真实结构,哪些是后期配色。
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